refactor: 重构/prompt/目录为/resource/ - 更符合资源引用协议语义

- 重命名核心目录: /prompt/ → /resource/
- 更新PackageDiscovery中所有硬编码路径引用
- 重新生成package.registry.json，61个资源全部更新为@package://resource/路径
- 批量更新文档中的路径引用，保持一致性
- 目录结构保持不变：domain/, core/, protocol/, tool/子目录结构完全一致

重构原因: 随着tool协议的加入，prompt目录名称不再准确描述系统本质
重构价值: 为未来资源生态扩展奠定清晰的命名基础

🤖 Generated with [Claude Code](https://claude.ai/code)

Co-Authored-By: Claude <noreply@anthropic.com>

docs/resource-referrence-architech.md

@@ -257,7 +257,7 @@ sequenceDiagram
 
     Note over RM: 2. 解析逻辑协议 thought
     RM->>RR: resolve("thought:remember")
-    RR->>RM: "@package://prompt/core/thought/remember.thought.md"
+    RR->>RM: "@package://resource/core/thought/remember.thought.md"
 
     Note over RM: 3. 解析基础协议 @package
     RM->>RM: 委托给PackageProtocol